Specijalni kontejneri uključuju, ali nisu ograničeni na sljedeće vrste:
Reefer Container: Dizajniran za transport smrznute ili niskotemperaturne robe kojoj je potrebna određena temperatura, pogodan za utovar mesa, voća i druge robe. Kontejneri za hladnjače imaju izolovane zidove, vrata, dno i vrhove, što može spriječiti razmjenu topline između iznutra i izvana. Dijele se na unutrašnje mehaničke rashladne kontejnere i vanjske mehaničke rashladne kontejnere.
Kontejner za vješalice: Posebno se koristi za transport odjeće, s prečkama i vješalicama iznutra kako bi se olakšao viseći transport gotove odjeće.
Kontejner sa otvorenim vrhom: Nema krutog vrha, platna, plastične folije, itd. kao nadstrešnica, pogodan za utovar robe čija visina prelazi maksimalnu granicu visine kontejnera.
Kontejner sa ravnim regalom: Kontejner bez gornjeg i bočnog zida, ili čak krajnjeg zida, ali samo donje ploče i četiri ugaona stuba, pogodan za nošenje ultra-visoke i ultra široke robe, stoke i gole robe koja je izuzeta od vanjsko pakovanje.
Kontejner cisterna: Posebno se koristi za transport tečne ili gasovite robe, kao što su alkohol, benzin, hemikalije, itd., koji se sastoji od rezervoara i okvira.
High Cube: Viši od standardnih kontejnera, obično se koriste za robu velike zapremine, ali ne preteške, kao što je laka roba.
Ravni stalak: bez fiksnih zidova i vrhova, pogodan za preveliku ili previsoku robu, kao što su velike mašine i oprema, građevinski materijal itd.
Otvorena strana: Sa dodatnim bočnim vratima, pogodan je za utovar i istovar robe sa strane, obično se koristi za dugačku robu ili robu kojoj je potreban bočni pristup.
Kontejner za opasnu robu: Kontejner koji se posebno koristi za transport opasnih materija, u skladu sa međunarodnim propisima o transportu opasnih materija.
Roll-on/Roll-off: Koristi se za transport vozila, sa otvorenim ili potpuno otvorenim repom kako bi se olakšao ulazak i izlazak vozila.
